Es ist ein stürmischer Morgen, als im Anne-Frank-Haus in Amsterdam Kitty zum Leben erwacht. Wie von Zauberhand wächst aus den Zeilen des berühmten Tagebuchs die Figur eines Teenagers mit roten Haaren, strahlendem Gesicht und blauen Augen. So wie ihre Schöpferin Anne Frank sie beschrieben hat, steht die nun lebendige Kitty plötzlich im menschenleeren Museum. So startet der Animationsfilm "Wo ist Anne Frank".
Kitty weiß nicht, was sich nach dem letzten Tagebucheintrag ereignet hat. Für sie ist die Zeit stehen geblieben. Nach und nach begreift sie, dass aus ihrer Erfinderin eine Berühmtheit geworden ist: Straßen, Schulen und Theater sind nach Anne Frank benannt. Von Anne selbst fehlt aber jede Spur. Sie macht sich auf die Suche …
"Tu alles, um eine einzige Menschenseele zu retten!", sagt Kitty in der Geschichte. "Schon eine einzelne Kinderseele ist so viel wert wie ein ganzes Leben".
Der Film erzählt mit der Leichtigkeit heutiger Jugendkultur trotz des schweren Thema.